Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2C6

Upk1b, Uroplakin-1b, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk1bQ9Z2C6 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Upk1bQ9Z2C6 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Upk1bQ9Z2C6 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Upk1bQ9Z2C6 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Upk1bQ9Z2C6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Upk1bQ9Z2C6 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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