Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z260

Cldn8, Claudin-8, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn8Q9Z260 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cldn8Q9Z260 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cldn8Q9Z260 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Cldn8Q9Z260 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cldn8Q9Z260 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Cldn8Q9Z260 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Cldn8Q9Z260 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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