Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1T1

Ap3b1, AP-3 complex subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3b1Q9Z1T1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ap3b1Q9Z1T1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ap3b1Q9Z1T1 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102.9 ms