Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cacna2d3Q9Z1L5 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cacna2d3Q9Z1L5 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms