Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1E3

Nfkbia, NF-kappa-B inhibitor alpha, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfkbiaQ9Z1E3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
NfkbiaQ9Z1E3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms