Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0G9

Cldn3, Claudin-3, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn3Q9Z0G9 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Cldn3Q9Z0G9 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Cldn3Q9Z0G9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Cldn3Q9Z0G9 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Cldn3Q9Z0G9 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Cldn3Q9Z0G9 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cldn3Q9Z0G9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms