Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV80

Snx1, Sorting nexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx1Q9WV80 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Snx1Q9WV80 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Snx1Q9WV80 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms