Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV35

Apobec2, C->U-editing enzyme APOBEC-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec2Q9WV35 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Apobec2Q9WV35 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms