Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUZ7

Sh3bgr, SH3 domain-binding glutamic acid-rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bgrQ9WUZ7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Sh3bgrQ9WUZ7 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sh3bgrQ9WUZ7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms