Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU40

Lemd3, Inner nuclear membrane protein Man1, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lemd3Q9WU40 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Oaz1-203ENSMUST00000179172 744 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Oaz1-ps-201ENSMUST00000052440 681 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Lemd3Q9WU40 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lemd3Q9WU40 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lemd3Q9WU40 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lemd3Q9WU40 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lemd3Q9WU40 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Lemd3Q9WU40 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lemd3Q9WU40 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lemd3Q9WU40 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lemd3Q9WU40 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lemd3Q9WU40 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lemd3Q9WU40 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lemd3Q9WU40 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lemd3Q9WU40 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms