Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU39

Scnn1g, Amiloride-sensitive sodium channel subunit gamma, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1gQ9WU39 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Scnn1gQ9WU39 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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Scnn1gQ9WU39 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Scnn1gQ9WU39 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Scnn1gQ9WU39 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
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Scnn1gQ9WU39 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Scnn1gQ9WU39 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Scnn1gQ9WU39 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Scnn1gQ9WU39 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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Scnn1gQ9WU39 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Scnn1gQ9WU39 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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Scnn1gQ9WU39 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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