Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTX2

Prkra, Interferon-inducible double-stranded RNA-dependent protein kinase activator A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkraQ9WTX2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PrkraQ9WTX2 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PrkraQ9WTX2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms