Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6cQ9WTM3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6cQ9WTM3 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6cQ9WTM3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Sema6cQ9WTM3 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sema6cQ9WTM3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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