Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0D8

Wdr54, WD repeat-containing protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr54Q9R0D8 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Wdr54Q9R0D8 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Wdr54Q9R0D8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms