Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0B6

Lamc3, Laminin subunit gamma-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc3Q9R0B6 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Ntan1-202ENSMUST00000115805 984 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 A330069E16Rik-201ENSMUST00000181191 887 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Lamc3Q9R0B6 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Aif1-201ENSMUST00000025257 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Lamc3Q9R0B6 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms