Protein–RNA interactions for Protein: Q9R087

Gpc6, Glypican-6, mousemouse

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc6Q9R087 Tmem2-201ENSMUST00000025663 6585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Gpc6Q9R087 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gpc6Q9R087 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms