Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AmfrQ9R049 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms