Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZQ0

Npas3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npas3Q9QZQ0 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Npas3Q9QZQ0 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Npas3Q9QZQ0 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms