Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Copg1Q9QZE5 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms