Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD5

Chml, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChmlQ9QZD5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ChmlQ9QZD5 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms