Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Trpc3Q9QZC1 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Trpc3Q9QZC1 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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Trpc3Q9QZC1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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Trpc3Q9QZC1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Trpc3Q9QZC1 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Trpc3Q9QZC1 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc3Q9QZC1 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc3Q9QZC1 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Trpc3Q9QZC1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc3Q9QZC1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc3Q9QZC1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc3Q9QZC1 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc3Q9QZC1 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc3Q9QZC1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc3Q9QZC1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Trpc3Q9QZC1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc3Q9QZC1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc3Q9QZC1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc3Q9QZC1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc3Q9QZC1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc3Q9QZC1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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Trpc3Q9QZC1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc3Q9QZC1 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc3Q9QZC1 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc3Q9QZC1 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Trpc3Q9QZC1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
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