Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYA2

Tomm40, Mitochondrial import receptor subunit TOM40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm40Q9QYA2 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Tomm40Q9QYA2 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms