Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
VapbQ9QY76 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
VapbQ9QY76 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
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