Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxnb3Q9QY40 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxnb3Q9QY40 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxnb3Q9QY40 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxnb3Q9QY40 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxnb3Q9QY40 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxnb3Q9QY40 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxnb3Q9QY40 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxnb3Q9QY40 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxnb3Q9QY40 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxnb3Q9QY40 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxnb3Q9QY40 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Plxnb3Q9QY40 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Atad3aos-201ENSMUST00000067628 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Plxnb3Q9QY40 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms