Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Foxe3Q9QY14 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Foxe3Q9QY14 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms