Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Trip4Q9QXN3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms