Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 9330182L06Rik-201ENSMUST00000069538 4688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Trim44Q9QXA7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Trim44Q9QXA7 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Zmym4-201ENSMUST00000106108 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Trim44Q9QXA7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
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