Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Gm9908-201ENSMUST00000211534 448 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Wdyhv1-201ENSMUST00000067563 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Trpc5Q9QX29 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 4933405L10Rik-202ENSMUST00000211852 1097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Trpc5Q9QX29 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms