Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWH1

Phc2, Polyhomeotic-like protein 2, mousemouse

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Length 850 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc2Q9QWH1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Phc2Q9QWH1 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms