Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rai2Q9QVY8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rai2Q9QVY8 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms