Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG7

Hdgfl3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl3Q9JMG7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
Hdgfl3Q9JMG7 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Hdgfl3Q9JMG7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms