Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMA7

Cyp3a41a, Cytochrome P450 3A41, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp3a41aQ9JMA7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cyp3a41aQ9JMA7 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms