Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM13

Rabgef1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabgef1Q9JM13 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
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Rabgef1Q9JM13 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Rabgef1Q9JM13 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Rabgef1Q9JM13 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Rabgef1Q9JM13 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Rabgef1Q9JM13 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
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Rabgef1Q9JM13 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
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Rabgef1Q9JM13 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Rabgef1Q9JM13 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Rabgef1Q9JM13 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
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