Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLK7

Cabp1, Calcium-binding protein 1, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cabp1Q9JLK7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cabp1Q9JLK7 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cabp1Q9JLK7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms