Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL95

Prg3, Proteoglycan 3, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prg3Q9JL95 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Alms1-ps2-201ENSMUST00000160606 1170 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Prg3Q9JL95 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms