Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL16

Isg20, Interferon-stimulated gene 20 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Isg20Q9JL16 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
Isg20Q9JL16 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms