Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC12.19□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC12.18□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.18□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC12.18□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC12.18□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.18□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC12.17□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC12.17□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC12.17□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
AtrQ9JKK8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC12.17□□□□□ -0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms