Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK54

Msgn1, Mesogenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msgn1Q9JK54 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Msgn1Q9JK54 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Msgn1Q9JK54 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Msgn1Q9JK54 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Msgn1Q9JK54 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Msgn1Q9JK54 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Msgn1Q9JK54 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msgn1Q9JK54 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msgn1Q9JK54 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msgn1Q9JK54 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msgn1Q9JK54 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Msgn1Q9JK54 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msgn1Q9JK54 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msgn1Q9JK54 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msgn1Q9JK54 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msgn1Q9JK54 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Msgn1Q9JK54 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msgn1Q9JK54 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msgn1Q9JK54 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msgn1Q9JK54 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msgn1Q9JK54 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msgn1Q9JK54 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msgn1Q9JK54 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Msgn1Q9JK54 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Msgn1Q9JK54 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Msgn1Q9JK54 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms