Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Efcc1Q9JJF6 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms