Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Rpf2Q9JJ80 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Rpf2Q9JJ80 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms