Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tcirg1Q9JHF5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tcirg1Q9JHF5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms