Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Tssc4Q9JHE7 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Tssc4Q9JHE7 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms