Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQW4

Cyp3a44, Cytochrome P450, CYP3A, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp3a44Q9EQW4 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Cyp3a44Q9EQW4 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Cyp3a44Q9EQW4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cyp3a44Q9EQW4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms