Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQH4

Taf8, Transcription initiation factor TFIID subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf8Q9EQH4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Taf8Q9EQH4 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Taf8Q9EQH4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms