Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Vmn1r29Q9EQ41 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Vmn1r29Q9EQ41 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Vmn1r29Q9EQ41 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Vmn1r29Q9EQ41 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Vmn1r29Q9EQ41 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Vmn1r29Q9EQ41 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Vmn1r29Q9EQ41 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Vmn1r29Q9EQ41 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Vmn1r29Q9EQ41 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Vmn1r29Q9EQ41 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Vmn1r29Q9EQ41 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Vmn1r29Q9EQ41 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vmn1r29Q9EQ41 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r29Q9EQ41 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vmn1r29Q9EQ41 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Vmn1r29Q9EQ41 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Vmn1r29Q9EQ41 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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