Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ16

Cxcr6, C-X-C chemokine receptor type 6, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr6Q9EQ16 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Cxcr6Q9EQ16 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Cxcr6Q9EQ16 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Cxcr6Q9EQ16 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
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Cxcr6Q9EQ16 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Cxcr6Q9EQ16 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
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