Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ08

Sgsh, Heparan N-sulfatase, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SgshQ9EQ08 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SgshQ9EQ08 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms