Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Adam15-201ENSMUST00000029676 2975 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Tspan4Q9DCK3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Tspan4Q9DCK3 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Tspan4Q9DCK3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Tspan4Q9DCK3 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Tspan4Q9DCK3 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Tspan4Q9DCK3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Tshz2-202ENSMUST00000109159 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Tspan4Q9DCK3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Col22a1-202ENSMUST00000159993 8809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
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Tspan4Q9DCK3 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Cdc73-201ENSMUST00000018337 11586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
Tspan4Q9DCK3 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
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