Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Hmgn3Q9DCB1 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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