Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC48

Cdc40, Pre-mRNA-processing factor 17, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc40Q9DC48 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdc40Q9DC48 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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